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陈颖丽

2016-07-08 文字:  点击:[]

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陈颖丽

教授,博士生导师

内蒙古大学开云(中国)Kaiyun官方网站卓越楼1116

地址:内蒙古呼和浩特市赛罕区大学西路235

邮编:010021

电话:0471-4992914

传真:0471-4993141

Email: stchenyl@imu.edu.cn




个人简历

教育情况

1993.09-1997.07  内蒙古大学物理系应用物理专业,获学士学位

1997.09-2000.07  内蒙古大学物理系理论物理专业,获硕士学位

2002.09-2007.07  内蒙古大学物理系理论物理专业,获博士学位

工作经历

2000.07-2008.10  内蒙古大学理工学院物理系,助教、讲师

2005.08-2015.11  内蒙古大学开云(中国)Kaiyun官方网站,教工党支部书记、党总支组织委员

2008.11-2019.11  内蒙古大学开云(中国)Kaiyun官方网站,副教授、硕士生导师

2010.03-2011.03  美国弗吉尼亚理工大学计算机科学系,访问学者

2019.12-至今     内蒙古大学开云(中国)Kaiyun官方网站,教授

2020.12-至今     内蒙古大学开云(中国)Kaiyun官方网站,博士生导师




教学

任职以来,先后承担了本科生《工程数学》、《复变函数与数理方程》、《数学物理方法A/B/C》、《原子物理A/B》、《量子力学C》和研究生学位课《生物信息学》等课程的讲授,目前主讲本科生课程《量子力学C》和《原子物理学》。是自治区级精品课程“量子力学”教学团队的主要成员;是自治区级教学团队“量子物理系列课程教学团队”的主要成员;具体负责本科主干核心课《原子物理学》的课程建设;是自治区级课程思政示范课程——研究生专业学位课《生物信息学》的主讲教师之一,该教学团队获批课程思政教学名师或团队称号。

主持教学项目


1. 数学物理方法课程思政元素建设的探索与实践. 教育部高等学校物理学类专业教学指导委员会立项的课程教学研究项目(项目编号:JZW-19-SL-01),2019.08-2021.08.

2. 讨论课和合作性学习在数学物理方法课程教学中的应用. 教育部高等学校物理学类专业教学指导委员会立项的课程教学研究项目(项目编号:JZW-16-SL-03),2016.08-2018.08.

3. 原子物理学,内蒙古大学课程思政示范课改革试点建设项目2019-2020.

4. 原子物理学,内蒙古大学本科主干核心课程建设项目2019-2021.

5. 原子物理学,内蒙古大学校级线下一流本科课程建设项目,2020-2021.

发表教学论文


1. 陈颖丽. 应用物理专业数学物理方法课程的教学改革初探,物理与工程 201222222-224.

2. 赵国军,陈颖丽. 哈密顿-雅可比方程与薛定谔方程的关系浅析,时代报告,20125: 98.



培养研究生情况

已经培养硕士研究生14人,现有在读硕士研究生7人,每年拟招硕士研究生1-2人、博士研究生1-2人。指导的1篇硕士生学位论文获评内蒙古自治区2020年度优秀硕士学位论文。




研究领域

主要从事理论生物物理、生物信息学方向的研究。目前主持和完成国家自然科学基金项目2项、教育部科学研究重点项目1项、教育部第46批留学回国人员科研启动基金项目1项、内蒙古自然科学基金项目2项。作为主要合作者参与完成国家自然科学基金项目多项。发表学术论文50余篇,其中两篇研究论文分别已被SCI引用182次和159次,成果中推广和改进了最小离散增量算法,提出了两种新的组合预测算法,取得了很好的预测效果,该方法被国内外同行多次使用和借鉴,得到了国内外同行的广泛关注和好评,科研成果荣获2016年度内蒙古自治区自然科学奖二等奖。


目前主要研究:

      1.  长链非编码RNA的结构与功能研究;

      2.  表观遗传修饰与人类疾病(特别是癌症)关系研究;

      3.  特定功能蛋白质亚细胞位置、功能模体和相关问题的理论研究。


主持的科研项目

1. 长链非编码RNA的亚细胞定位预测,国家自然科学基金项目,2019.01-2022.12.

2. 细胞凋亡蛋白质亚细胞定位数据集的构建及定位信息的分析与预测,国家自然科学基金项目,2014.01-2017.12.

3. 细胞凋亡蛋白质的亚细胞定位与功能模体相关问题的理论研究,教育部科学技术研究重点项目,2012.01-2014.12.

4. 细胞凋亡蛋白质亚细胞水平数据库的构建及亚细胞定位信息的提取与分析,教育部第46批留学回国人员科研启动基金资助项目,2013.06-2014.12.

5. 细胞凋亡蛋白质亚细胞位置中序列模体和信号网络信息的提取与分析研究,内蒙古自治区自然科学基金项目,2012.01-2014.12.

6. 细胞凋亡蛋白质的结构与亚细胞位置的关系研究,内蒙古自治区自然科学基金项目,2008.07-2010.12.



奖励荣誉或兼职

 

2016年12月获2016年度内蒙古自治区自然科学奖二等奖

2013年9月获第三届自治区高等学校教坛新秀奖

2012年10月入选自治区“新世纪321人才工程”第二层次人选

2012年10月博士论文被评为首届内蒙古自治区优秀博士学位论文

2008年11月获内蒙古大学第四届科学技术创新成果奖一等奖

2010年3月获内蒙古大学第五届科学技术创新成果奖一等奖

2019年11月获内蒙古大学乌可力优秀青年教师奖

2020年6月获内蒙古大学校级大学生创新创业训练计划项目“优秀指导教师”

担任内蒙古生物物理与生物信息学会秘书长,2021年-2024年



主要论著

主要论著

1.      Yuan-Yuan Zhai, Qian-Zhong Li*, Ying-Li Chen, Lu-Qiang Zhang. Identification of Key Histone Modifications and Hub Genes for Colorectal Cancer Metastasis. Current Bioinformatics, DOI: 10.2174/1574893616999210805164414.

2.      Yingli Chen*, Donghua Guo, Qianzhong Li*. An energy model for recognizing the prokaryotic promoters based on molecular structure. Genomics. 2020, 112(2): 2072-2079.

3.      Yong-Chun Zuo, Yuan Li, Ying-Li Chen, Guang-Peng Li, Zhen-He Yan, Lei Yang. PseKRAAC: A flexible web server for generating pseudo K-tuple reduced amino acids composition. Bioinformatics. 2017, 33 (1): 122-124.

4.      Ying-Li Chen, Qian-Zhong Li and Liqing Zhang, Using increment of diversity to predict mitochondrial proteins of malaria parasite: integrating pseudo amino acid composition and structural alphabet. Amino Acids 2012, 42(4): 1309-1316.

5.      Ying-Li Chen and Qian-Zhong Li. Prediction of apoptosis protein subcellular location using improved hybrid approach and pseudo amino acid composition, J. Theor.Biol. 2007, 248(2):377-381.

6.      Ying-Li Chen and Qian-Zhong Li. Prediction of the subcellular location of apoptosis proteins, J. Theor.Biol. 2007, 245(4): 775-783.

7.      Yuanyuan Zhai, Yingli Chen*, Qianzhong Li, Luqiang Zhang. Exploration of the hub genes and miRNAs in lung adenocarcinoma. Oncology Letters. 2019, 18: 1713-1722.

8.      Hao Lin, Hao Wang, Hui Ding, Ying-li Chen and Qian-Zhong Li, Prediction of subcellular localization of apoptosis protein using chou’s pseudo amino acid composition. Acta Biotheoretica. 2009, 57(3):321-330.

9.      Yingli Chen*, Jintao Zhao. Prediction of the anti-apoptosis and pro-apoptosis proteins based on domain and motif information. European Biophysics Journal with Biophysics Letters. 2017, 46(1): S211.

10.     YuanYuan Zhai, YingLi Chen*, Yue Jiang, QianZhong Li. Weighted Gene Co-expression Network Analysis of Gene Modules for Lung Adenocarcinoma. The 2018 5th International Conference on Systems and Informatics (ICSAI 2018), 473-477.

11.      ZhenHe Yan, YingLi Chen* and JinTao Zhao. Using improved k-nearest neighbor method to identify anti- and pro-apoptosis proteins. 2015 8th International Conference on BioMedical Engineering and Informatics. In Proc. BMEI, 2015, p554-559.

12.      Ying-Li Chen, Qian-Zhong Li and Liqing Zhang, Prediction of mitochondrial proteins of malaria parasite using improved hybrid method and reduced amino acid alphabet. In Proc. BMEI, 2011, p1592-1596.

13.      Muqier, Yingli Chen, Qianzhong Li. Motif analysis of small genome sequence of avian reovirus. The 6th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE 2012) 2012, 2, 241-243.

14.      Ying-Li Chen, Qian-Zhong Li, Muqier. Identification of mitochondrial proteins by malaria parasite using increment of diversity fusion method and reduced amino acid alphabet. 17th International Biophysics Congress (IUPAB), Beijing, China, 2011.10.30-11.03, Poster.

15.     Muqier, Ying-Li Chen*, Qian-Zhong Li. Motif analysis of small genome sequence of avian reovirus. 17th International Biophysics Congress (IUPAB), Beijing, China, 2011.10.30-11.03, Poster.

16.      闫玲娟,陈颖丽*,闫冬雪,范芷妤. 多特征融合的植物长链非编码RNA的预测. 生物信息学,2021, 19(2): 128-135.

17.      陈颖丽,李前忠,杨科利,樊国梁. 基于离散增量结合支持向量机方法的凋亡蛋白亚细胞位置预测. 生物物理学报. 2007, 23(3):192-198.

18.      陈颖丽,李前忠,马克健. 大肠杆菌与酵母菌基因特定序列信息参数的研究. 生物物理学报.2001, 17(4): 676-684.


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